При использовании Fault Tolerance вы не можете использовать динамические (thin) диски. Это связано с тем, что FT использует режим multi-write для доступа к диску. Динамические диски, как и многие другие форматы, могут изменять метаданные VMDK, что крайне нежелательно для FT. Поэтому, единственный поддерживаемый для FT формат – это eager-zeroed thick. Кстати говоря, крайне рекомендуется использовать этот же формат для общих ресурсов кластера микрософт (MSCS) и для жестких дисков производственных машин.
Вот сравнение скоростей от Михаила Михеева. На данный момент создать диск такого формата можно только с помощью консольной утилиты vmkfstools.
А вот описание форматов от него же.

